जब छत्रपति शिवाजी महाराज के पुणे से जुड़ाव की बात आती है तो यह सबसे प्रमुख और महत्वपूर्ण स्थलों में से एक है। 1636 के आसपास निर्मित यह स्थान छत्रपति शिवाजी महाराज का बचपन का निवास स्थान था। यह वह स्थान है जहां छत्रपति शिवाजी महाराज ने राजमाता जिजाऊ माँ साहेब के साथ शिवनेरी में अपने जन्म के बाद रहने का फैसला किया था। समय के साथ मूल लाल महल लुप्त हो गया। हालाँकि, छत्रपति शिवाजी महाराज के इस स्थान के साथ विशेष संबंध और महत्व को देखते हुए, 20 वीं शताब्दी में उस स्थान पर एक स्मारक का पुनर्निर्माण किया गया था जहाँ मूल लाल महल खड़ा था।
छत्रपति शिवाजी महाराज बहुत ही कम समय के लिए इस महल में रुके थे। इसके अलावा उन्होंने राजगढ़ को अपनी सीट के रूप में चुना और शहर से दूर चले गये। हालाँकि, 1660 में एक मुगल जनरल शाइस्ता खान ने इस महल में डेरा डाला था। मुगल सम्राट का एक करीबी रिश्तेदार लगभग तीन वर्षों की अवधि तक महल में रहा। छत्रपति शिवाजी महाराज ने 1663 में अपने सैनिकों के साथ इस महल में प्रवेश किया था। जनरल और छत्रपति शिवाजी महाराज के बीच झड़प हुई जिसमें शाइस्ता खान दुर्भाग्य से भागने में सफल रहा, हालाँकि लड़ाई में उसने अपनी उंगलियाँ खो दीं।
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